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本作では犬と猫が同時に育てることが可能で、犬は53犬種240種、猫は18猫種100種類、合計71品種340種類以上登場します。犬種には新たに人気のパグとシーズーが追加されました。
■ゲームの目的はお店を大きくすること！
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たくさんペットを育て、新しい家族の元へ届けると、貢献度に応じて「ワンポ」が貯まります。一定のワンポとお店の評価が貯まれば、お店を4段階まで大きくすることが出来ます。一度ふれあったペットは、シールブックに「シール」として登録されます。シールブックに、すべてのシールを集められるでしょうか？目指せコンプリート！
■仔犬や仔猫と遊ぶ・しつける・お世話する
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たくさん触れ合うと「愛情度」、しつけをすると「かしこさ」、おやつをあげると「たくましさ」、ボール遊びをすると「社交性」がそれぞれアップします。また、シャワーを浴びないと病気になってしまう場合も・・・。
■ミニゲームでパラメーターUP!アイテムをゲット！
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| ハードル | クイズ | たからさがし |
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| シャボンだま | おさんぽ | はすの池 |
「ハードル」「クイズ」「たからさがし」「シャボンだま」「おさんぽ」「はるの池」の6種類。ミニゲームをクリアすると、ペットのステータスがアップします。ノーミスでクリアすると、よりたくさんステータスがアップします。隠されたプレゼントを入手すると、新しいシールやお店のカラー、BGMなどが手に入ります。
■いつかあの仔に出会えるかも・・・？
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冒頭に展開されるストーリーでは、空き地で見つけた仔犬（仔猫）の物語が展開されます。もしかしたら、またあの仔に逢えるかも知れません。
■お店のレイアウトやデザインは自由自在！オリジナルのお店を作ろう！
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ペットのケージやペットフード等のグッズ、観葉植物などを自由に配置する事が出来ます。なんでも自由に置けると言う訳でもなく、「猫の近くに魚を置いてはダメ」というように、配置にもそれぞれ工夫が必要になります。それ以外には壁や床、BGMを自分の好きな物にする事が可能です。
■ワイアレス通信で友達のペット屋さんに遊びに行ける
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通信することで、友達しか持っていない犬や猫などが貰うことが出来ます。遠くの人にはパスワードを使って送ることも可能です。
『まちのペット屋さんDS2 〜ワンニャン333匹大集合〜』は、2009年2月19日に5040円（税込）で発売予定です。
