2009年版の選手は、2008年のペナントレースの成績をパラメータに反映し、最新の選手登録情報に基づいたもの。各球団の50選手、12球団合計で600名のプロ野球選手データが最新版になる。また、選手のカードデザインも一新された。
選手は、ゲーム内ポイント「FP（ファミスタポイント）」を使用する「ファミスタスロット」、または有料の「FC（ファミスタコイン）」を使用する「ファミスタルーレット」から入手できる。
なお、既にゲーム内で獲得済みの2006年版から2008年版選手も引き続きゲームで使用できる。
そして、3月12日（木）メンテナンス前までの間、2つのキャンペーンで構成される「2009年版選手追加キャンペーン」が展開される。
「2009年版初期パックを全員に無料で配布！」では、3月5日（木）以降にゲームにログインしたユーザーに、監督新規作成時に貰える選手21名のセット「初期パック」が無料でプレゼントされる。
「2,009名様に超豪華Wチャンス！」では、ゲームにログインしたユーザー中から抽選で2,009名に、ゲーム内チケットやゲームアイテムなどが進呈される。
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