「水郷決戦史」では、新たな合戦場「湿地」や「罠」などが追加される。
そして、報奨品に「収納箱」が追加される。「収納箱」には4種類（「鉱石採集品収納箱」「木材採集品収納箱」「発掘品収納箱」「薬草採集品収納箱」）が用意され、各「収納箱」は10のアイテム枠があり、1つの枠には最大で5,000個の素材を収納できる。
部曲関連のアップデートでは、砦内のBGMが変更できる「古筝（こそう）」や、簡単なメッセージを残すことが可能な「伝言板」などが追加され、さらに10種類の新しい家具が用意される。
また、「三国志」の故事に基づいたる中・上級者向けの依頼（クエスト）も導入される。依頼には、曹操が張繍（ちょうしゅう）との戦いでのどの渇きに苦しむ兵士に「この先に梅林がある」と叱咤激励しのどを潤わせた故事をベースにしたものなどがある。これらの依頼を受領するには、総合レベルのほかにも、その武将との親密度が関わってくる場合もある。
このほかにも、「キャラクタの表示・非表示切り替え」「地図上で武将・NPCの位置が確認できる」など、プレイヤーの利便性を高める要素の追加や、「闘技仕合」における「復活時の怪我状態を撤廃」「門の耐久度をレベル帯に応じて調整」「マッチングシステムの改善」の仕様変更などが行われる。
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